Diagramme de cordes
Un tableau croisé en diagramme de cordes : chaque catégorie sur l’anneau, un lien par case aussi large que son effectif, les noms autour.
Variables qualitatives (effectifs) · Tableau de contingence · 5 crédits
Lancer cette figure (nouvel onglet)1.Définition
La figure
Un tableau croisé en diagramme de cordes : chaque catégorie sur l’anneau, un lien par case aussi large que son effectif, les noms autour.
L’analyse statistique : Tableau de contingence
Croise deux variables qualitatives (lignes × colonnes) et teste leur association par le χ² de Pearson ou le test exact de Fisher ; les résidus disent quelles cases tirent l’association.
2.Lancer l’analyse
Les étapes de « Nouvelle analyse », dans l’ordre : ce que chacune demande, et pourquoi.
Étape 1 : Choisir la figure
Ouvrez « Nouvelle analyse », famille « Effectifs » du ruban, puis cette figure.
Pourquoi : Chaque figure a ses propres options : la choisir d’abord fixe celles qui la font et masque celles des autres figures.
Étape 2 : Importer les données
Un fichier CSV, TXT ou Excel (.xlsx, .xls) de 50 Mo et 200 000 lignes au plus, ou « Utiliser le jeu d’exemple » : sur lui, la figure est gratuite.
Pourquoi : Le fichier est lu dans votre navigateur : seules les colonnes que vous choisirez partiront au calcul, et elles sont effacées du serveur au bout de 24 h.
Étape 3 : Vérifier le type des colonnes
Chaque colonne est reconnue numérique, catégorielle ou texte ; un clic sur son type le change.
Pourquoi : Le rôle qu’une colonne peut prendre dépend de son type : un facteur codé 1, 2, 3 doit passer en catégorielle pour être lu comme des groupes.
Étape 4 : Attribuer les rôles
Dites ce que représente chaque colonne, et ce que la figure vous demande :
- Deux variables qualitatives, ou un tableau d’effectifs déjà fait
- Facultatif : une colonne d’effectifs
Pourquoi : Les rôles disent au moteur ce qui est mesuré, ce qui l’explique et ce qui groupe les observations : la même table répond à des questions différentes selon eux.
Étape 5 : Régler les options
Les options qui font cette figure sont déjà fixées. Restent :
- Une ligne par observation, ou un tableau déjà fait : Le moteur compte lui-même les observations, ou lit vos effectifs (une colonne de libellés et une colonne par catégorie).
- Ordre des catégories : Celui du fichier, ou par effectifs décroissants ; une catégorie garde sa couleur quoi qu’il arrive.
Pourquoi : Les valeurs par défaut sont les conventions des revues ; ne les changez que pour une raison que vous sauriez écrire dans votre section Méthodes.
Étape 6 : Lancer le calcul
Gratuit et complet sur le jeu d’exemple. Sur vos données : 5 crédits débités au lancement ; sans assez de crédits, un aperçu flouté, à débloquer pour 5 crédits.
Pourquoi : Le calcul est fait par R sur nos serveurs, et vous suivez ses étapes. S’il échoue, les crédits sont rendus.
Étape 7 : Lire les résultats
Les tableaux, l’interprétation en français ou en anglais et le paragraphe « Méthodes » prêt pour votre manuscrit.
Pourquoi : Chaque chiffre vient de R, et chaque phrase est un modèle rempli avec eux, jamais un texte inventé : vérifiez-les avec les tableaux.
Étape 8 : Télécharger la figure
PNG 300 DPI, PDF, EPS ou SVG, à 89 ou 183 mm ; les textes se modifient dans l’éditeur de figure.
Pourquoi : 89 mm est la largeur d’une colonne de revue, 183 mm celle d’une page : la figure est mise en page pour chacune, rien ne s’y chevauche.
3.Pourquoi et quand l’utiliser
Quand l’utiliser
Pour montrer les associations entre deux variables qualitatives comme des flux, notamment quand les catégories sont nombreuses.
Exemple de question : Quelles espèces viennent de quelles zones de pêche ?
Ce que les résultats montrent
- Si les deux variables sont liées (χ², p) et avec quelle force (V de Cramér et son IC).
- Les cases plus fréquentes (bleu) ou plus rares (rouge) qu’attendu sous l’indépendance.
- Les flux d’une catégorie à l’autre (Sankey, cordes) ou les effectifs (ballons).
4.Méthode et packages R
Ce que le moteur R exécute pour cette figure : les packages, les fonctions principales, les étapes du calcul et les formules.
Packages R
- stats
- multcompView
- effectsize
- ggrepel
chisq.test(table) · fisher.test(table)
Fonctions principales
| Fonction | Package | Rôle |
|---|---|---|
| chisq.test | stats | χ² de Pearson |
| fisher.test | stats | test exact de Fisher |
| svd | base | analyse des correspondances |
| multcompLetters | multcompView | lignes comparées deux à deux |
Ce que fait le script, dans l’ordre
- Construit le tableau croisé et les effectifs attendus.
- Choisit le test par la règle de Cochran : χ² si les attendus sont assez grands, sinon Fisher (exact ou Monte-Carlo).
- Calcule le V de Cramér, les résidus standardisés ajustés et leurs p, les contributions.
- Analyse des correspondances (AFC) par décomposition en valeurs singulières.
- Dessine mosaïque, ballons, Sankey ou cordes (ggplot2).
Formules principales
χ² de Pearson
χ² = Σ (Oᵢⱼ − Eᵢⱼ)² / Eᵢⱼ, Eᵢⱼ = (total ligne i × total colonne j) / N
O observés, E attendus si les variables étaient indépendantes. (r − 1)(c − 1) ddl.
V de Cramér
V = √(χ² / (N · (min(r, c) − 1)))
Entre 0 (aucun lien) et 1 (lien parfait), comparable entre tableaux de tailles différentes.
Résidu standardisé ajusté
rᵢⱼ = (Oᵢⱼ − Eᵢⱼ) / √(Eᵢⱼ (1 − pᵢ.)(1 − p.ⱼ))
|r| > 2 : la case s’écarte nettement de l’indépendance (au-dessus si positif).
À citer
- Fisher, R. A. (1922). On the interpretation of χ² from contingency tables, and the calculation of P. Journal of the Royal Statistical Society, 85(1), 87-94. doi:10.2307/2340521 (nouvel onglet)
- Benjamini, Y. & Hochberg, Y. (1995). Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing. Journal of the Royal Statistical Society, Series B, 57(1), 289-300. doi:10.1111/j.2517-6161.1995.tb02031.x (nouvel onglet)
5.Données d’entrée
Une ligne par observation avec 2 à 4 colonnes catégorielles (et une colonne d’effectifs en option), ou un tableau d’effectifs.
Ce que la figure demande
- Deux variables qualitatives, ou un tableau d’effectifs déjà fait
- Facultatif : une colonne d’effectifs
Format : CSV, TXT ou Excel, une ligne d’en-tête avec le nom des colonnes. La virgule ou le point décimal, le séparateur et l’encodage sont reconnus seuls ; une case vide est une valeur manquante.
Le jeu d’exemple : Pêche artisanale du Saloum
Rôles : Le tableau Zone × Espece : un lien par case, aussi large que son effectif.
6.Prix
5crédits
par lancement sur vos données. Chaque figure coûte 5 crédits, quelle qu’elle soit : la figure, ses tableaux, son interprétation et ses téléchargements sont compris.
| Pack | Prix du pack | Cette figure |
|---|---|---|
| Starter (50 crédits) | 500 FCFA | 50 FCFA |
| Standard (250 crédits) | 2 000 FCFA | 40 FCFA |
| Pro (700 crédits) | 5 000 FCFA | 36 FCFA |
- Gratuite sur son jeu d’exemple (peche_saloum.csv), résultats complets : pour la découvrir avant d’importer vos données.
- Sur vos données sans assez de crédits, elle se lance quand même en aperçu flouté, débloqué ensuite pour 5 crédits sans relancer le calcul.
- Si le calcul échoue, les crédits sont rendus.
- Paiement par mobile money ; voir les packs.
Lancer « Diagramme de cordes » sur vos données
Ou ouvrez-la gratuitement avec son jeu d’exemple pour voir chaque étape et des résultats complets avant d’importer votre fichier.